Dans le cadre de sa plateforme Humanités numériques, la MSHB a mis en place plusieurs collaborations avec d'autres structures de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche au niveau local et national.

Ces collaborations ont notamment donné lieu à l'organisation de plusieurs manifestations scientifiques et actions de formation autour de la thématique des humanités numériques et de la gestion des données de recherche.